Comment calculer le point isoélectrique de Peptides

July 27

Comment calculer le point isoélectrique de Peptides


Les peptides sont des fragments de polymère courtes composées à partir d'acides aminés. Chaque peptide a une séquence d'acides aminés certaine désignée par un code à trois lettres ou à une lettre; par exemple, l'alanine amino-acide est l'abréviation "Ala" ou "A" La charge des peptides dans la solution dépend de l'acidité de la solution. Le point isoélectrique (pI) se réfère à la valeur solution d'acidité à laquelle la molécule de peptide a la charge nette de zéro. La solubilité du peptide est minime au point isoélectrique. Utiliser des serveurs web disponibles pour calculer la valeur de pI pour une séquence peptidique d'acides aminés.

Instructions

1 Écrire la séquence peptidique en utilisant le code à une lettre. Par exemple, si un peptide présente une séquence d'acides aminés Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine-Serin-acide glutamique-Leucine-Proline), puis la séquence est une lettre "ASELP". Si nécessaire, consulter le tableau de conversion de trois lettres pour une lettre donnée dans les ressources.

2 Utilisez un navigateur Web, Internet Explorer ou Firefox, par exemple, pour accéder à un serveur qui calcule le point isoélectrique de peptide (pI); voir Ressources.

3 Entrez "le ASELP" du peptide à une lettre dans notre exemple dans la boîte, et cliquez sur "Calculer".

4 Lire le point isoélectrique (pI) valeur donnée dans la ligne "pI théorique / Mw." Dans notre exemple, le pI est de 4,00. Notez que le serveur calcule également le poids moléculaire (Mw) du peptide.