Le déséquilibre de liaison est un concept important dans la génétique qui se produit quand un génotype à un locus dépend d'un génotype à un autre locus. La dépendance de ces deux génotypes signifie que la fréquence de certaines combinaisons d'allèles peut être différent de ce qu'on pourrait attendre si l'on considère les allèles séparément. Le déséquilibre de liaison est un concept important à comprendre lorsque l'on étudie la recombinaison génétique, et peut être calculé avec une compréhension suffisante de la génétique et de la probabilité.
Instructions
1 Déterminer la fréquence des haplotypes. Par exemple, si vous avez deux loci (A, B), chacun avec deux allèles (A1, A2, B1, B2), que il y aura quatre haplotypes: A1B1, A1B2, A2B1, A2B2. A titre d'exemple, supposons que les fréquences sont de 0,5, 0,25, 0,15 et 0,1, respectivement.
2 Déterminer les fréquences des allèles en termes de fréquence d'haplotype. Par exemple, pour trouver la fréquence de l'allèle A1, vous résumer les fréquences A1B1 et A2B2 (dans notre exemple, 0,5 et 0,25, respectivement, donnant 0,75), et de trouver la fréquence de l'allèle B1, vous résumer les fréquences de A1B1 et A2B1 (dans notre exemple, 0,5 et 0,15 respectivement, ce qui donne 0,65).
3 Multiplier les fréquences des allèles A1 et B1 de l'étape précédente ensemble. Sous forme d'équation, cela ressemble (A1B1 + A2B2) * (A1B1 + A2B1). Dans l'exemple ci-dessus, les fréquences sont de A1 et B1 sont 0,75 et 0,65, respectivement. Multipliant les nombres ensemble donne 0,4875.
4 Soustraire la fréquence des haplotypes de A1B1 provenant de l'étape 1 par la valeur obtenue à l'étape 3. Le nombre résultant est le déséquilibre de liaison. Dans notre exemple, la fréquence des haplotypes de A1B1 est de 0,5 et la valeur de l'étape 1 est 0,4875, ce qui entraîne une valeur de déséquilibre de liaison de 0,125.
Conseils et avertissements
- Une valeur de déséquilibre de liaison de zéro indique une indépendance complète des allèles, alors qu'une valeur de un indique la dépendance complète.