A la fin de "Assassin Creed" Desmond va repérer les messages laissés par Sujet 16 à travers sa vision d'aigle. Après revivre les souvenirs d'Altaïr, Desmond connaît "l'effet de saignement", où il a conservé certaines des compétences de son ancêtre. Ces messages laissés par Sujet 16 sont des astuces et des indices sur un certain artefact que l'ordre des Templiers modernes, Abstergo, est à la recherche.
Triangle
Desmond verra un triangle sur le sol quand il quitte sa chambre. Le texte de ce triangle se lit: "Ils drainés mon âme et en ont fait leur que j'essoré mon corps pour vous montrer où je l'ai vu.». Sujet 16 a écrit ce message se référant à Abstergo lui et son corps à l'aide de revivre les souvenirs de son ancêtre à travers le Animus. La dernière partie du texte fait référence à l'aide de son propre sang pour laisser les indices et les messages derrière.
Bloc de mots
À côté du triangle de mots sur le sol, il y aura un bloc avec des personnages. Cette écriture se lit: "Les artefacts envoyés vers le ciel pour contrôler toutes les nations, de nous faire obéir une croisade cachée Ne pas les aider.». Ici Sujet 16 fait référence au plan de Abstergo pour trouver l'artefact et de l'utiliser à son avantage.
Yonaguni
Situé sur la fresque du mur est "Yonaguni," le nom d'une île au Japon. On croit qu'une civilisation avancée a vécu sur cette île. Il peut aussi symboliser qu'un autre assassin ancêtre avait vécu sur cette île.
Nombres
Également situé à travers la peinture murale sont différentes lignes de nombres. "1221201" et "13.0.0.0.0" se réfèrent tous à la date: 12/21/2012. Si le joueur a lu à travers les e-mails de Vidic tout au long et à la fin du jeu, il va voir quelque chose au sujet d'un certain jour de lancement en Décembre 2012. La date est également le dernier jour marqué trouvé sur le mésoaméricain, ou Maya, Long calendrier compte.
Structures et pyramides
Les structures et les pyramides situées tout au long de la fresque signifient différents endroits où des artefacts importants peuvent être tenues. Ces artefacts connus sous le nom "Pieces of Eden" jouent un rôle important dans la suite des jeux "Assassin Creed" et préfigurent le scénario du jeu. Les joueurs peuvent voir les pyramides mayas et des bâtiments japonais.