A la base du microscope de dissection est une plaque de platine, une surface plane conçue pour supporter l'échantillon en cours de visualisation. Selon la nature de l'échantillon, il est éclairé par une source lumineuse, soit au-dessus ou au-dessous. Relativement minces objets translucides sont souvent mieux éclairés par le dessous. Dans ce cas, la lumière est transmise à travers l'objet et souligne souvent la structure détaillée de l'intérêt pour le spectateur.
Un morceau de support vertical d'une forme ou une autre prend en charge une partie du champ d'application de dissection qui abrite les lentilles de l'objectif, l'oculaire ou de lentilles oculaires et les boutons de mise au point. Les morceaux de l'oeil sont au sommet de cette unité. Ils sont généralement en paires et permettent ainsi à l'utilisateur une vue en stéréo. En règle générale, les pièces oculaires sont 10 puissance, ce qui signifie qu'ils magnifient un objet 10 fois. L'oculaire fonctionne en conjonction avec ce qu'on appelle lentilles d'objectifs situés plus bas sur l'appareil. Il peut y avoir deux ou plusieurs lentilles objectives permettant différents grossissements.
Concentrer les boutons --- habituellement deux, une de chaque côté --- mécaniquement fixé à la pièce de support verticale. Cela permet à l'utilisateur de tourner le bouton de mise au point et de déplacer le boîtier de l'appareil, les pièces oculaires et les lentilles de l'objectif vers le haut ou vers le bas pour mettre le sujet au point.
La plupart des microscopes de dissection possèdent la capacité de déplacer les pièces d'oeil pour compenser ce qu'on appelle la distance inter-pupillaire. Cela permet aux utilisateurs des yeux wider- ou plus étroites réglé pour avoir une position confortable et efficace. En outre, l'une des pièces de l'oeil peut avoir un ajustement appelé dioptrique qui permet à l'utilisateur d'ajuster les différences de capacités de vision entre les yeux gauche et droit.
Typiquement, le microscope de dissection aura une plaque de verre transparent ou translucide incorporé dans l'étape (la surface au niveau de la base du microscope, dans lequel l'utilisateur place l'objet pour un affichage). Ce qui permet la transmission de la lumière, le cas échéant sélectionnés, par en dessous. Il peut ou peut ne pas être des clips de scène utilisés pour tenir un objet ou d'un matériau en place sur la scène du microscope.